W eliminacjach do Pucharu Narodów Afryki 2017 wzięły udział 52 afrykańskie reprezentacje państwowe^[1]. W kwalifikacjach uczestniczyła reprezentacja Gabonu, która posiadała pewne miejsce w fazie grupowej jako gospodarz turnieju Puchar Narodów Afryki 2017. Z tej przyczyny jej mecze były traktowane jako spotkania towarzyskie.

Losowanie kwalifikacji odbyło się 8 kwietnia 2015 roku w Kairze^[2].

Ze względu na wycofanie się Maroka z organizacji pucharu w 2015, Maroko było pierwotnie wykluczone przez CAF z turniejów w 2017 i 2019 roku. Jednak zakaz został anulowany przez Trybunał Arbitrażowy do spraw Sportu, co oznacza, że Maroko weźmie udział w eliminacjach^[3].

Lista reprezentacji biorąca udział w kwalifikacjach

W eliminacjach nie brały udziału reprezentacje  Erytrea i  Somalia,

^[4]

Do Pucharu Narodów Afryki 2017 zakwalifikowali się zwycięzcy grup, oraz dwa najlepsze zespoły z drugich miejsc.

Legenda:

• Msc. – miejsce,
• M – liczba rozegranych meczów,
• W – mecze wygrane,
• R – mecze zremisowane,
• P – mecze przegrane,
• Br+ – bramki zdobyte,
• Br- – bramki stracone,
• Pkt. – punkty (3 za zwycięstwo, 1 za remis, 0 za porażkę)

Po rozegraniu wszystkich meczów grupowych do turnieju finałowego awansuje zwycięzca każdej grupy i dwie drużyny, które zajęły 2. miejsca i zdobyły najwięcej punktów. W przypadku gdy dwie lub więcej drużyn uzyskają tę samą liczbę punktów, o awansie decydują kolejno kryteria określone przez CAF^[5]:

Gdy dokładnie dwie drużyny mają tyle samo punktów, o awansie decyduje:

1. Liczba punktów zdobytych przez drużyny w bezpośrednich spotkaniach między nimi;
2. Bilans bramek obu drużyn w meczach między zainteresowanymi zespołami;
3. Liczba bramek drużyn w bezpośrednich starciach;
4. Bilans bramek obu drużyn we wszystkich spotkaniach grupowych;
5. Liczba strzelonych bramek we wszystkich meczach w grupie;
6. Losowanie

Gdy więcej niż dwie drużyny mają tyle samo punktów, o awansie decyduje:

1. Liczba punktów zdobytych przez drużyny w bezpośrednich meczach rozegranych między nimi;
2. Bilans bramek drużyn z uwzględnieniem meczów, które rozegrały one między sobą;
3. Liczba zdobytych bramek przez drużyny w spotkaniach między nimi;
4. Liczba bramek strzelonych w meczach wyjazdowych rozegranych między nimi;
5. Jeżeli po rozpatrzeniu punktów 1-4 dwie drużyny ciągle zajmują ex-aequo jedno miejsce, punkty 1) do 4) rozpatruje się ponownie dla tych dwóch drużyn, aby ostatecznie ustalić ich pozycje w grupie. Jeśli ta procedura nie wyłoni zwycięzcy, stosuje się po kolei punkty od 6 do 9;
6. Bilans bramek obu drużyn, z uwzględnieniem wszystkich meczów w grupie;
7. Liczba strzelonych bramek we wszystkich meczach w grupie;
8. Liczba bramek strzelonych we wszystkich meczach wyjazdowych;
9. Losowanie

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa A.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Tunezja	6	4	1	1	16	3	+13	13
2	Togo	6	3	2	1	11	4	+7	11
3	Liberia	6	3	1	2	11	8	+3	10
4	Dżibuti	6	0	0	6	1	24	-23	0

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa B.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Demokratyczna Republika Konga	6	5	0	1	16	6	+10	15
2	Republika Środkowoafrykańska	6	3	1	2	9	11	-2	10
3	Angola	6	1	2	3	7	8	-1	5
4	Madagaskar	6	0	3	3	5	12	-7	3

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa C.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Mali	6	5	1	0	13	3	+10	16
2	Benin	6	3	2	1	12	10	+2	11
3	Gwinea Równikowa	6	1	1	4	6	6	0	4
4	Sudan Południowy	6	1	0	5	3	15	-12	3

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa D.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Burkina Faso	6	4	1	1	6	2	+4	13
2	Uganda	6	4	1	1	6	2	+4	13
3	Botswana	6	2	0	4	5	8	-3	6
4	Komory	6	1	0	5	2	7	-5	3

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa E.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Gwinea Bissau	6	3	1	2	7	7	0	10
2	Kongo	6	2	3	1	9	7	+2	9
3	Zambia	6	1	4	1	7	7	0	7
4	Kenia	6	1	2	3	5	7	-2	5

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa F.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Maroko	6	5	1	0	10	1	+9	16
2	Republika Zielonego Przylądka	6	3	0	3	11	6	+5	9
3	Libia	6	2	1	3	8	6	+2	7
4	Wyspy Świętego Tomasza i Książęca	6	1	0	5	4	19	-15	3

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa G.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Egipt	4	3	1	0	7	1	+6	10
2	Nigeria	4	1	2	1	2	2	0	5
3	Tanzania	4	0	1	3	0	6	-6	1
4	Czad	0	0	0	0	0	0	0	0

 Czad wycofał się w trakcie kwalifikacji, w związku z tym wszystkie mecze tej drużyny zostały unieważnione.

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa H.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Ghana	6	4	2	0	14	3	+11	14
2	Rwanda	6	2	1	3	9	6	+3	7
3	Mozambik	6	2	1	3	5	7	-2	7
4	Mauritius	6	2	0	4	3	15	-12	6

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa I.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Wybrzeże Kości Słoniowej	4	1	3	0	3	2	+1	6
2	Sierra Leone	4	1	2	1	2	2	0	5
3	Sudan	4	1	1	2	2	3	-1	4

 Gabon również znajduje się w tej grupie i będzie grać przeciwko pozostałych trzem drużynom tej grupy. Jednak te mecze będą rozpatrywane tylko jako towarzyskie i nie będą się liczyć do klasyfikacji.

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa J.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Algieria	6	5	1	0	25	5	+20	16
2	Etiopia	6	3	2	1	11	14	-3	11
3	Seszele	6	1	1	4	5	11	-6	4
4	Lesotho	6	1	0	5	5	16	-11	3

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa K.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Senegal	6	6	0	0	13	2	+11	18
2	Burundi	6	2	1	3	7	9	-2	7
3	Namibia	6	2	0	4	5	9	-4	6
4	Niger	6	1	1	4	2	7	-5	4

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa L.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Zimbabwe	6	3	2	1	11	4	+7	11
2	Suazi	6	2	2	2	6	9	-3	8
3	Gwinea	6	2	2	2	5	5	0	8
4	Malawi	6	1	2	3	5	9	-4	5

 Osobny artykuł: Puchar Narodów Afryki 2017 (kwalifikacje)/Grupa M.

Msc.	Zespół	M	W	R	P	Br+	Br-	+/-	Pkt
1	Kamerun	6	4	2	0	7	2	+5	14
2	Mauretania	6	2	2	2	6	5	+1	8
3	Południowa Afryka	6	1	4	1	8	6	+2	7
4	Gambia	6	0	2	4	1	9	-8	2

Grupa	Zespół	M	W	R	P	G+	G-	+/-	Pkt
D	Uganda	6	4	1	1	6	2	+4	13
A	Togo	6	3	2	1	11	4	+7	11
C	Benin	6	3	2	1	12	10	+2	11
J	Etiopia	6	3	2	1	11	14	-3	11
B	Republika Środkowoafrykańska	6	3	1	2	9	11	-2	10
F	Republika Zielonego Przylądka	6	3	0	3	11	6	+5	9
E	Kongo	6	2	3	1	9	7	+2	9
M	Mauretania	6	2	2	2	6	5	+1	8
L	Suazi	6	2	2	2	6	9	-3	8
H	Rwanda	6	2	1	3	9	6	+3	7
K	Burundi	6	2	1	3	7	9	-2	7
G	Nigeria	4	1	2	1	2	2	0	5
I	Sierra Leone	4	1	2	1	2	2	0	5

7 goli

• El Arbi Hillel Soudani

6 goli

• Getaneh Kebede

5 goli

• Stéphane Sessègnon
• Fiston Abdul Razak
• Férébory Doré
• William Jebor

4 gole

• Islam Slimani
• Mohamed Salah
• Youssef El-Arabi

3 gole

2 gole

1 gol

Bramki samobójcze

• Ahmed El Trbi dla Wysp Świętego Tomasza i Książęcej
• Njabulo Ndlovu dla Zimbabwe
• Jemal Tassew dla Seszeli